所谓阴道菌群置换术并非手术，它的原理主要是利用消毒杀菌剂把阴道内包括正常菌群在内的所有微生物杀死，再换上实验室培养出的纯阴道分支杆菌，以维持阴道内正常环境。正常女性阴道内存有大量的分支杆菌，它可以产生大量乳酸，使阴道内的PH值维持在3-4之间，从而抑制其他微生物的繁殖，被称其为阴道卫士，起到阴道自洁作用。阴道分支杆菌是其他病原微生物的天敌，它的减少或缺失是阴道炎的内在病因。