因在临床中发现易不良反应而不宜同服。中药新癀片、银黄颗粒与清热解毒口服液同用，桂枝茯苓胶囊与丹莪妇康煎膏同用，益胆片与胆康胶囊同用等，均会导致不良反应。
    因易导致药源性肠炎、抗菌药抗菌作用降低而不宜同服。中药安神补心胶囊不能与西药溴化物及碘化物同用，否则易导致药源性肠炎；亦不宜与氨基糖苷、大环内酯类抗菌药合用，否则易导致抗菌药抗菌作用降低。
    因在胃肠道相互作用而不宜同服。含朱砂（含Hg++）的中成药，如：朱砂安神丸、健脑九、梅花点舌丸、人丹、七珍丹、七厘散、紫雪丹、苏合香丸、冠心苏合丸等，不宜与具有还原性西药，如：涅化钾、溴化钠、碘化钾、碘化钠、硫酸亚铁、亚硝酸盐等同服。因为它们在胃肠道中可生成具有毒性的溴化汞或碘化汞沉淀物，引起赤痢样大便，导致药源性肠炎。
    因药物代谢方面的作用而不宜同服。含有乙醇的中成药，如：风湿骨痛药、国公酒等药酒，不宜与西药苯巴比妥、苯妥英钠、D860、降糖灵、胰岛素、华法令等同用。因为乙醇是一种药酶诱导剂，能使肝脏药酶活性增强，使上述西药代谢加速，半衰期缩短，药性下降，而代谢不佳自然就胖。
    因药效学上相互作用而不宜同服。含激素成分的中药主要有甘草、鹿茸、人参、鹿茸片、参茸丸、甘草浸膏片、脑灵素等均有糖皮质激素样作用，可使血糖升高（人参作用较弱），减弱降血糖药的疗效。故不宜与降血糖药，如：胰岛素、优降糖、降糖灵、D860等合用。
因药物排泄方面相互作用而不宜同服。中药乌梅、山萸肉、五味子及其中成药山碴丸、乌梅安蛔丸、五味子丸等含有机酸，不宜与磺胺类药物同用。因磺胺类抗菌素在酸性尿中易析出结晶，可引起结晶尿、血尿或尿闭等不良反应。