今后三年政府卫生投入重点用于“基本、基层、基础”建设，具体来说包括三个方面：医师基本公共卫生局不均等化，政府预算全额安排专业公共卫生机构的人员经费、发展建设、公用经费和业务经费；按项目免费向城乡居民提供统一的基本公共卫生服务。二是基层医疗卫生服务体系建设，支持农村三级卫生服务网络和城市社区卫生服务网络建设，政府负责举办的乡镇卫生院、城市社区卫生服务中心（站），按国家规定的基本建设、设备购置、人员经费及其承担公共卫生服务的业务经费，使其正常运行，提供低成本服务。三是基本医疗保障制度建设，逐步提高政府对居民医保和新农合的补助标准，用两年左右时间将关闭破产企业退休人员和困难企业职工纳入城镇职工医保。此外，各级镇南关福还将为建立健全基本药物制度、推进公立医院改革试点提供必要资金支持。经初步测算，2009-2011年各级政府需要投入8500亿元用于支持五项重点改革，其中中央政府投入3318亿元。