北京市现在接种的疫苗共分2类，即第一类疫苗和低二类疫苗。

        第一类疫苗是指政府免费向公民提供，公民应当依照政府的规定受种的疫苗，接种第一类疫苗由政府承担费用。北京市纳入第一类疫苗范围的包括：卡介苗、脊髓灰质炎减毒活疫苗糖丸（简称脊灰疫苗）、无细胞百日咳、白喉、破伤风联合疫苗（简称无细胞百白破疫苗）、吸附白喉破伤风联合疫苗（简称白破疫苗）、麻疹、腮腺炎、风疹减毒活疫苗（简称麻腮风疫苗）、重组乙型肝炎疫苗（简称乙肝疫苗）、乙型脑炎减毒活疫苗（简称乙脑减毒活疫苗，）、A群脑膜炎球菌多糖疫苗（简称A群流脑疫苗）、A+C群脑膜炎球菌多糖疫苗（简称A+C群流脑疫苗）、麻风二联疫苗、甲肝灭活疫苗。

        此外，对发生水痘疫情的托幼园所、中小学校15岁以下儿童免费应急接种水痘疫苗；对重点人群进行出血热疫苗、炭疽疫苗和钩体疫苗免费应急接种。
通过接种上述16种疫苗，预防乙型肝炎、甲型肝炎、结核病、脊髓灰质炎、百日咳、白喉、破伤风、麻疹、流行性脑脊髓膜炎、流行性乙型脑炎、风疹、流行性腮腺炎、水痘、流行性出血热、炭疽和钩端螺旋体病等16种传染病。

        第二类疫苗是指由公民自费并且自愿受种的其他疫苗，接种第二类疫苗由受种者或者其监护人承担费用。目前包括肺炎球菌多糖疫苗、B型流感嗜血杆菌疫苗、人用狂犬病疫苗、口服轮状病毒活疫苗水痘疫苗、流感疫苗、出血热疫苗、兰菌净疫苗等。